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Séquences

Liste des séquences nucléotidiques déposées dans les banques de données internationnales par l'équipe "Ecogénétique, Evolution et Adaptations moléculaires chez les organismes marins".

Légende
DS = Daniel. SELLOS
AVW = Alain. VAN WORMHOUDT
AR = Ali. RIGAA
SLM = Soizig. LE MOINE
CLB = Christine. LE BOULAY
BK = Birgit. KLEIN
LA = Laetitia. ARENA
PLC = Patrick. LE CHEVALIER
BX = Bingze. XU
SI = Samuel. IGLESIAS
LL = Lauriana LEVY

 

Identifiant Type Auteur(s) Longueur
X53 330  Core histone gene cluster DS 6051 bp
X 66 415  Preprochymotrypsin 1 cDNA DS/AVW 1068 bp
X 67 246  P. maximus 12S cDNA DS/AR 856 bp
X 71 091   P. m. mitochondrial DNA repeat regions DS/AR 1592 bp
X 77 318  Preamylase 1 cDNA AVW/DS 1620 bp
X 80 659  P.maximus tRNA gene AR/DS 300 bp
X 80 660  P. maximus tRNA gene AR/DS 300 bp
X 80 989  N. norvegicus Eyestalk cathepsin cDNA CLB/AVW
/DS
1167 bp
X 80 990  N. norvegicus stomach cathepsin cDNA AVW/CLB
/DS
1093 bp
X 82 501  P. maximus mitochondrial16S cDNA DS 1407 bp
X 82 502  P. vannamei Hemocyanin cDNA DS/SLM 2096 bp
X 82 502  P. vannamei Cytochrome-Oxydase I gene DS 1512 bp
X 85 127  P. vannamei cathepsin L cDNA CLB/AVW
/DS
1068 bp
X 86 369  P. vannamei trypsin I cDNA AVW/BK
/DS
854 bp
X 87 682  M. baltica Metalothionein AR 300 bp
X 92 688  P. maximus mitochondrial 12S, 16S, NDI, COI genes DS/AR 5500 bp
X 99 729  P. maximus mRNA for -amylase DS et al. 1645 bp
X 99 730  P. vannamei cathepsin L2 cDNA CLB/DS
/AVW
1065 bp
Y 08 370  C. gigas mRNA for -amylase SLM/DS 1654 bp
Y 10 664  P. vannamei chymotrypsin A gene DS/AVW 1522 bp
Y 10 665  P. vannamei chymotrypsin B gene DS/AVW 1526 bp
Y 10 666  P. vannamei chymotrypsin C gene DS/AVW 397 bp
Y 14 965  P. vannamei cathepsin gene I CLB/DS
/AVW
1793 bp
Y 13 925  P. vannamei cathepsin gene II CLB/DS
/AVW
967 bp
Y 14 966  P. vannamei cathepsin gene III CLB/DS
/AVW
511 bp
X 99 731  cDNA de l’hormone hyperglycémiante de P. V AVW 656 bp
Y 11 722  cDNA de l’hormone hyperglycémiante de P. V AVW .
Y 11 723  cDNAs de l’hormone dispersing pigments (PDH) AVW/DS 458 bp
Y 11 724  cDNA Protooncogene Rho-RAS P. V. AVW 656 bp
Y 11 725  cDNA du TGF- b chez la crevette P.V. AVW .
Y 13 924  cDNA du TGF- b chez la crevette P.V. AVW .
Y 15 039  Gène I de trypsine de Penaeus vannamei AVW/BK
/DS
1206 bp
Y 15 040  Gène II de trypsine de Penaeus vannamei AVW/BK
/DS
1219 bp
Y 15 041  Gène III de trypsine de Penaeus vannamei AVW/BK
/DS
1328 bp
AJ 132 780  sequence ADN 16S de Penaeus vannamei AVW/LA
/DS
1841 bp
AJ 133 526  P. vannamei alpha-amylase gene I. AVW/DS 3230 bp
AJ 132 379  P. vannamei alpha-amylase gene II DS/AVW 2678 bp
AJ 132 788  P. vannamei alpha-amylase gene IV DS/AVW 3352 bp
AJ 132 380  Nephrops norvegicus PEPCK cDNA AVW 2445 bp
AJ 132 381  P. vannamei partial mRNA for Actin AVW 797 bp
AJ 250 829  P.vannamei mRNA for PEPCK (P. v.) AVW/LA 2186 bp
AJ 250 830  P.vannamei mRNA for hemocyanin II AVW/DS 2240 bp
AJ 250 828  P.vannamei mRNA for a-glucosidase AVW/PLC
/DS
3027 bp
AF 320 688  C. gigas amylase gene A DS/AVW 6033 bp
AF 321 515  C. gigas amylase gene B DS/AVW 5299 bp
en cours Mytilus edulis cDNA de la Mannanase BX/DS 983 bp
AJ 271 364  Mytilus edulis cDNA de la CMCase BX/DS 717 bp
en cours Mytilus edulis gène A de la Mannanase BX/DS 2410 bp
en cours Mytilus edulis gène B de la Mannanase BX/DS 1973 bp
ALIGN-000084 Mytilus edulis gène I de la CMCase BX/DS 4456 bp
AJ308 548  Mytilus edulis gène II de la CMCase BX/DS 2964 bp
AF 327 706  16SrDNA requin Scyliorhinus stellaris SI/DS 1508 bp
AF 327 706  16SrDNA requin Galeus melastomus SI/DS 1504 bp
AF 329 373  16SrDNA requin Galeus murinus SI/DS 1503 bp
AF 329 374  16SrDNA requin Apristurus Sp. "B SI/DS 1500 bp
AF 329 375  16SrDNA requin Apristurus manis SI/DS 1506 bp
F 329 376  16SrDNA requin Apristurus laurussonii SI/DS 1500 bp
AJ 297 970  16SsDNA crevette Penaeus vannameii LA/AVW 1380 bp
AJ 297 971  16SrDNA crevette Penaeus setiferus LA/AVW 1384 bp
AF358 916  16SrDNA requin Apristurus aphiodes SI/DS 1505 bp
AF382 947  16SrDNA requin Apristurus microps SI/DS 1507 bp
AY049050  16SrDNA requin Mustellus asterias SI/DS 1507 bp
AY049049  16SrDNA requin Pseudotriakis microdon SI/DS 1504 bp
AY049048  16SrDNA requin Apristurus exsanguis SI/DS 1504 bp
AY049051  6SrDNA requin Apristurus Sp "A SI/DS 1500 bp
en cours 16SrDNA requin Centrocymnus coelolepis SI/DS 1300 bp
en cours 16SrDNA requin Centrophorus squamosus SI/DS 1300 bp
en cours Promoteur gene amy Penaeus vannamei DS/AVW 602 bp
en cours D-loop requin Centrocymnus coelolepis SI/DS 1100 bp
en cours ITS-1 requin Centrocymnus coelolepis SI/DS 700 bp
en cours 16SrDNA lotte Lophius piscatorius LL/DS 1129 bp
en cours 16SrDNA lotte Lophius budegassa LL/DS 1129 bp
en cours séquence ITS1 lotte Lophius budegassa LL/DS 705 bp
en cours séquence D-Loop lotte Lophius piscatorius LL/DS 1050 bp
X66 415  Penaeus vannamei Preprochymotrypsin 1 cDNA DS/AVW 1068 bp
X77 318  Preamylase 1 cDNA AVW/DS 1620bp
X80 990  N. norvegicus stomach cathepsin cDNA AVW/CLB/DS 1093bp
X82 501  P. maximus mitochondrial16S cDNA DS 1407bp
X82 502  P. vannamei Hemocyanin cDNA DS/SLM 2096bp
X82 503  P. vannamei Cytochrome-Oxydase I gene DS 1512bp
X85 127  P. vannamei cathepsin L cDNA CLB/AVW/DS 1068bp
Y13 924  P. vannamei cathepsin L gene I CLB/DS/AVW 1793bp
AJ297 970  16SrDNA crevette Penaeus vannameii LA/AVW 1380bp
AJ250829  P.v Phosphoenolpyruvate-carboxykinase PEPCK AVW 2186bp
AF465509  P.v Internal transcribed spacer - 1, ITS1 AVW 820bp
AF465508  P. stylitostris ITS1 AVW 790bp
AF463512  P.japonicus ITS1 AVW 729bp
AF463511  P. notiialis ITS1 AVW 832bp
AF463510  P. schmitti ITS1 AVW 846bp
AY074918  P. setiferus ITS1 AVW 812bp
AY074919  P. indicus ITS1 AVW 831bp
AY074921  P. monodon ITS1 AVW 719bp
AY074920  Alpheus lottini ITS1 AVW/CD 1829bp
AY074923  Chasmagnathus granulata Actine AVW/VS 841bp
Y074922  Chasmagnathus granulata PEPCK AVW/VS 2270bp
AJ496534  Microsatellite intron 7 amylase P. vannamei AVW 389bp
AJ496537  Microsatellite intron 7 amylase P. setiferus AVW 420bp
J496535  Microsatellite intron 7 amylase P.ris AVW 313bp
AJ496536  Microsatellite intron 7 amylase P. notialis AVW 286bp
AJ496606  Oikopleura dioica amylase gene AVW 2488bp
AJ496596  Crassostrea gigas amylase alleles A1 AVW 7196bp
AJ496597  Crassostrea gigas amylase alleles A2 AVW 7196bp
AJ496598  Crassostrea gigas amylase alleles A3 AVW 7196bp
AJ496599  Crassostrea gigas amylase alleles A4 AVW 7196bp
AJ496600  Crassostrea gigas amylase alleles A5 AVW 7196bp
AJ496601  Crassostrea gigas amylase alleles A6 AVW 7196bp
AJ496602  Crassostrea gigas amylase alleles B1 AVW 4869bp
AJ496603  Crassostrea gigas amylase alleles B2 AVW 4869bp
AJ496604  Crassostrea gigas amylase alleles B3 AVW 4869bp
AJ496605  Crassostrea gigas amylase alleles B4 AVW 4869bp
ALIGN_000427 Crassostrea gigas alignement alleles A1-A6 AVW 7196bp
ALIGN_000428 Crassostrea gigas alignement alleles B1-B4 AVW 4869bp
- en cours P. vannamei Glutamate deshydrogenase (GDH) AVW  
- en cours Promoteur gene amy Penaeus vannamei AVW 602bp

Nombreux EST (Expressed Sequence Tags) sur ces invertébrés modèles non encore intégrés dans les banques.